大分県のフリースクール補助金と支援

先に全体像をお伝えします。2026年9月15日の時点で、大分県が県として保護者に利用料を補助する制度は、県教育委員会の公式サイトでは確認できていません。そのかわり市の制度として、別府市と日田市の2市で利用料補助の公式ページを確認できました。つまり大分県では、お住まいの市町村によって補助の有無と内容が変わります。この記事では、別府市と日田市の制度の中身、申請の流れ、補助がない市町村での費用の見方、フリースクールに通った日の出席扱い、相談窓口、県内の施設の探し方を順に見ていきます。

制度名は「別府市フリースクール等利用児童生徒支援補助金」で、2024年5月2日に市のページに追加され、2026年4月1日に更新されています。補助の対象は、市長が基準を満たすと確認したフリースクール等に保護者が支払う利用料です。金額は、1か月にフリースクールへ納める利用料（入学料や施設整備費の類は除く）の4分の3で、生活保護または就学援助を受けている世帯は10分の10、つまり全額です。100円未満は切り捨てで、月額30,000円が上限です。市は「予算の範囲内において」と書いているので、年度途中で予算に達する可能性も頭に入れておいてください。

一般世帯なら4分の3で18,000円、就学援助世帯なら全額の24,000円が計算上の補助額です。月謝が40,000円の場合は4分の3で30,000円になり、ちょうど上限と同じです。ただし入学料や施設整備費は対象外なので、入会金の分は自己負担のままです。実際の額は市の認定と実績報告にもとづいて決まるので、この計算はあくまで目安として見てください。

別府市のページには、補助対象者の要件が4つ書かれていて、全部を満たす必要があります。学校に行きづらさを感じている児童生徒がフリースクール等に原則通所していること、子どもの様子などの情報を在籍校とフリースクール等が相互に共有することを保護者が承諾すること、市や県の相談機関と必要に応じて連携できること、この補助金以外に利用料への補助や助成を受けていないことです。2つ目の「学校との情報共有への承諾」は、あとで扱う出席扱いの話ともつながる大事な点です。

日田市の「フリースクール利用料補助金」は、令和7年4月分から補助金額が変わっています。対象は日田市の小中学校に在籍し、日田市に住所がある児童生徒の保護者で、在籍校に登校が困難なこと、市教育委員会が認定したフリースクールに原則として週1回以上通所する予定であること、認定施設が在籍校と教育委員会に子どもの様子を情報提供することを承諾すること、世帯員に市税の滞納がないこと、同じ経費に別の団体から補助を受けていないことが条件です。補助率は、生活保護受給世帯または就学援助を受けている世帯が10分の10で月額30,000円まで、それ以外の世帯が2分の1で月額15,000円までです。対象は保護者が負担する利用料に相当する経費で、入会金や交通費、教材費、実習費などは除かれます。

当サイトが2026年9月15日時点で公式ページを確認できたのは別府市と日田市の2件です。ほかの市町村については、制度がないと言い切るのではなく「公式ページで確認できていない」という段階です。制度は年度ごとに新設や変更があるので、お住まいの市町村教育委員会に「フリースクールの利用料に対する補助や減免はありますか」と電話で聞くのが確実です。全国の自治体の傾向はフリースクールの補助金｜自治体の制度と調べ方にまとめています。

市のページに載っている様式の並びから、申請の順番を見ていきます。

別府市のページには「申請書をダウンロードし、学校教育課へお申し込みください」とあり、様式は大きく4種類あります。最初に「補助対象者 認定申請書」を出して、補助を受けられる保護者として認定を受けます。そのあと利用した分について「交付申請兼実績報告書」と、施設が記入する「利用確認書兼補助対象経費報告書」を出し、最後に「交付請求書」で振込を請求する、という並びです。つまり先に認定を受けてから、利用実績を報告して受け取る後払いの仕組みです。各書類の提出時期や添付書類は交付要綱と「申請の流れ」の資料で決まっているので、認定申請の前に学校教育課安全支援係（電話0977-21-1574）に一度電話して、必要なものを確認してから動くと手戻りが減ります。

日田市も、先に認定を受けてから請求する2段階です。認定申請は「補助を受けようとする月の末日まで」に、認定申請書（様式第1号）に補助対象経費の月額がわかる書類を添えて学校教育課へ出します。認定後は、交付申請書兼請求書（様式第6号）に利用状況報告書（様式第7号）と領収書などを添えて提出します。提出期限は利用した期間ごとに決まっていて、4月1日から7月31日までの利用分は8月末日まで、8月1日から12月31日までの利用分は翌年1月末日まで、1月1日から3月31日までの利用分は4月10日までです。この期限を過ぎると請求できない可能性があるので、領収書は月ごとに保管しておいてください。

施設に直接「日田市（または別府市）の補助金の対象施設になっていますか」と聞くのが早いです。日田市の場合、施設側が市に認定申請をする仕組みで、大分県教育委員会のフリースクール等認証を受けている施設は、そのことを証する書類の写しを添えると、パンフレット・利用条件・職員体制の3種類の書類を省略できると書かれています。県の認証制度は令和7年度に始まったもので、認証を受けた施設は市の認定手続きも進めやすい関係になっています。

その場合は、施設の料金を直接見ながら組み立てることになります。県内の掲載施設の料金を例に見てみましょう。

当サイトに掲載している大分県内の施設で、公式サイトに金額が明記されているのは2件です。大分市のあすらんフリースクールは、対象が小学生・中学生で、活動時間は10時00分から14時00分です。月謝は週5日が26,000円、週3日（火・木・金）が24,000円で、入会金は22,000円です。週5日のコースは「来れるときに無理なく登校可能」と書かれています。

豊後大野市のここのね自由な学校は、自らをオルタナティブスクールと位置づけている施設で、コースが複数あります。全日制コースは月曜日から木曜日まで活動に参加するもので、対象は小学校1年生から中学校3年生、入学金100,000円（入学時のみ）、学費が年504,000円で12回の分割（月42,000円）払い、昼食費が月4,500円です。週1から選べる通学コースは入学金30,000円で、週1利用が年158,400円（12回分割で月13,200円）、週2利用が年309,600円（同25,800円）、1か月利用が月48,000円です。金額はすべて税込で、任意のNPO会費が年6,000円あります。学区の公立校に通いながら通学コースを使う、という使い方も案内されています。

費用を抑える方法は3つあります。1つ目は、見学や体験を使ってから決めることです。あすらんは「お問い合わせ・教室見学」、ここのねは「相談・見学・体験申し込み」の導線を公式サイトに用意しています。2つ目は、週1や週3など回数の少ないコースから始めることです。3つ目は、費用が厳しいことを施設に率直に伝えて、減免や分割の相談ができるか聞くことです。ここのねは公式サイトで、経済的理由で諦める人や在校生の授業料を補助するための寄付を募っていると書いています。減免の有無は施設ごとに違い、公式サイトに書いていないことも多いので、聞いてみないとわかりません。全国の相場はフリースクールの費用はいくら｜月謝の相場と助成にまとめています。

大分県教育委員会の「大分県フリースクール等ガイドライン」（令和7年4月改訂版）は、実施主体・事業運営の目安として「著しく営利本位でなく、入会金、利用料（月額、年額等）等が明確にされ、保護者等に情報提供がなされている」ことを挙げています。料金が公式サイトや資料に明記されていて、聞けばきちんと説明してくれるかどうかは、施設を見るときのひとつの目安になります。見学で聞くことはフリースクールの見学｜聞くこと質問チェックリストに一覧があります。

県のガイドラインと文部科学省の通知の両方に根拠があります。次の節で見ます。

大分県教育委員会のガイドラインは、学校・家庭等との連携の目安として「指導要録上の出席扱いについて、希望がある児童生徒または保護者がいる場合、学校から出席扱いを受けられるよう学校と連携を図る体制が整っている」ことを施設に求めています。あわせて、施設と学校が定期的（月1回程度）に学習活動や出席状況などの情報を共有する体制も挙げられています。つまり県は、出席扱いを希望する家庭のために施設が学校と連携することを前提にしています。ただし、ガイドラインは施設の目安であって、出席扱いを保証するものではありません。

在籍校の校長です。根拠は文部科学省が令和元年10月25日に出した通知「不登校児童生徒への支援の在り方について」の別記1で、学校外の施設での相談・指導が子どもの社会的な自立を目指すものであり、登校を希望したときに円滑な学校復帰ができるよう適切な支援をしていると評価できる場合に、校長は指導要録上出席扱いとすることができる、という仕組みです。要件として、保護者と学校の間に十分な連携・協力関係が保たれていること、施設に通所または入所して相談・指導を受けることが挙げられ、民間施設が適切かどうかは校長が設置者である教育委員会と十分な連携をとって判断するとされています。

そのとおりです。別府市は在籍校と施設が相互に情報共有することへの承諾、日田市は認定施設が在籍校と教育委員会に情報提供することへの承諾を、補助の条件にしています。これは出席扱いの要件である「保護者と学校の十分な連携」と同じ方向を向いています。補助金の申請と出席扱いの相談を別々に進めるのではなく、通い始める前に担任や管理職に「この施設に通う予定で、市の補助金も申請する。出席扱いについても相談したい」と一度にまとめて伝えると、学校側も動きやすくなります。

ここのねは全日制コースの案内で、不登校になりそう・不登校である子について「調整の上、出席扱い可能です」と書いています。あすらんは公式サイトで、県教育委員会が把握する県内フリースクールに追加されていると案内しています。ただ、これらは各施設の案内であって、あなたのお子さんの場合に出席扱いになることを約束するものではありません。判断するのは在籍校の校長で、教育委員会との連携のうえで決まります。

県に無料の電話相談があります。最後に相談窓口と、施設の探し方を見ます。

小中高校生の不登校・ひきこもりに関する相談は、大分県教育センター教育相談部の電話相談（097-503-8987、相談専用）が窓口で、平日9時00分から17時00分に受け付けています。メール相談は24時間受け付けです。いじめや不登校、その他の悩み相談は大分県教育庁学校安全・安心支援課（097-506-5546）でも受けていて、電話は平日9時00分から17時00分、メールは24時間受付で返信には数日かかる場合があります。学校や教育委員会で解決しなかったトラブルは、大分県学校問題相談窓口（097-506-5598、平日10時から12時と13時から15時30分）という別の窓口があります。

大分県教育庁学校安全・安心支援課のページに「大分県内フリースクール一覧」が載っていて、県教育委員会が把握している施設を確認できます。同じページでは、県が不登校の子どもの親の会とも連携していると書かれています。県は令和7年度からフリースクール等認証制度を始めていて、認証の申請期間は4月から12月です。認証を受けた施設かどうかは、施設に聞くか県の学校安全・安心支援課（097-506-5546）に問い合わせてください。

大分県のフリースクール一覧に、公式サイトで所在地と連絡先を確認できた施設を載せています。2026年9月15日時点では大分市のあすらんフリースクールと豊後大野市のここのね自由な学校の2件です。県の一覧より少ないのは、公式サイトで情報を確認できたものだけを掲載しているためです。別府市や日田市の補助金を使う場合は、その市の対象施設かどうかを別途確認してください。近くに施設がない場合の考え方は近くにフリースクールがない時の選択肢にまとめています。

ガイドラインには県教育委員会の支援として3つが書かれています。フリースクール連絡協議会を開いて国や県の動向を周知し、不登校の子ども理解に関する講義を行うこと、施設からの要請に応じて在籍校のスクールカウンセラーやスクールソーシャルワーカーを派遣すること、希望する施設にICT家庭学習支援システムを提供することです。保護者から見れば、施設に通いながら学校のスクールカウンセラーとつながる道があるという意味で、施設に「県の派遣制度を使ったことはありますか」と聞いてみる材料になります。

それが一番早い入口です。同じ電話で認定申請に必要な書類も確認できます。子どもの様子を見ながら、無理のない回数から始めてください。